Yeni Malatyaspor'un 19 yıllık profesyonel lig serüveni, Türkiye Futbol Federasyonu Profesyonel Futbol Disiplin Kurulu'nun (PFDK) aldığı karar ile sona erdi. Kulüp, bu sezon Nesine 3. Lig 3. Grup'taki maçlarına katılmadığı için amatör lige düşürüldü.
Profesyonel Lig Yolculuğu
Malatya temsilcisi, 2006-2007 sezonunda 3. Lig'e yükselerek profesyonel liglerdeki serüvenine başlamıştı. Ardından 2009-2010 sezonunda 2. Lig'e geçiş yaptı. 2014-2015 sezonunda 2. Lig Beyaz Grup'ta şampiyon olarak 1. Lig'e yükselen Yeni Malatyaspor, 2016-2017 sezonunda ise Süper Lig'e çıkma başarısını gösterdi.
Süper Lig ve Avrupa Deneyimi
2017-2018 sezonunda Süper Lig'de mücadele eden sarı-siyahlı takım, ilk sezonunu 10. sırada tamamladı. 2018-2019 sezonunda ise 5. sırayı alarak tarihinin en başarılı derecelerinden birine imza attı. Aynı sezon Ziraat Türkiye Kupası'nı kazanan Galatasaray sayesinde UEFA Avrupa Ligi'ne katılma hakkı elde eden Yeni Malatyaspor, burada 3. eleme turuna kadar yükseldi.
Düşüş Süreci
2019-2020 sezonunda Süper Lig'i 16. sırada tamamlayan kulüp, Kovid-19 salgını nedeniyle küme düşme uygulamasının kaldırılmasıyla ligde kalmayı başardı. Ancak 2021-2022 sezonunu son sırada bitirerek Süper Lig'e veda etti. 2022-2023 sezonunda 1. Lig'de mücadele eden Yeni Malatyaspor, ligi 16 puanla tamamlayarak bir kez daha düşüş yaşadı.
Amatör Lige Dönüş
Kahramanmaraş merkezli depremler sonrası ligden çekilme hakkını kullanan Yeni Malatyaspor, 2023-2024 sezonunda müsabakalara katılmadı. 2024-2025 sezonunda 1. Lig'e döndü fakat puansız tamamlayarak 2. Lig'e düştü. Ekonomik sorunlar ve yetersiz oyuncu kadrosu nedeniyle 2. Lig'de yalnızca bir sezon geçiren kulüp, 3. Lig'e geriledi. Bu sezon da maçlara çıkmayan Yeni Malatyaspor, PFDK'nın kararı ile amatör lige düştü. 19 yıllık profesyonel lig serüveninin ardından, futbol serüvenine 1986 yılında başladığı amatör lige geri döndü. Bu durum, Malatya'da büyük bir üzüntüyle karşılandı.
